Pipete za ponovljivo pipetiranje je mogoče uporabiti pri kateri koli aplikaciji, ki zahteva ponovitve poskusov, ali v primerih, kjer sta natančnost in preciznost vzorcev ključnega pomena. Številni uporabniki na primer pipete za ponovljivo pipetiranje izberejo za postavitev reakcij PCR. Pipete za ponovljivo pipetiranje lahko odmerijo isto količino reakcijske zmesi PCR v vsako epruveto za PCR.
Poleg tega se pogosto uporabljajo tudi pri alikvotiranju kritičnih reagentov ali vzorcev v posode za dolgotrajno shranjevanje, kot je serum bolnika, ki ga je treba zamrzniti. Če se tak vzorec preprosto zamrzne v eni sami veliki količini, lahko nepotrebni cikli odmrzovanja ogrozijo nedotaknjenost vzorca ali biomarkerjev, ki so občutljivi na temperaturo.
Nazadnje je vzorce z visoko viskoznostjo ali hlapnostjo običajno težko pipetirati s pipetami z izpodrivanjem zraka. Razlog za to je, da sile, s katerimi pri pipetah z izpodrivanjem zraka te tekočine delujejo na zračni žep med batom in tekočino, povzročijo slabo ponovitev med posameznimi vzorci (slaba natančnost in preciznost). Pipete za ponovljivo pipetiranje občutno izboljšajo natančnost in preciznost pri aplikacijah ter protokolih, ki obravnavajo zahtevne tekočine.