Manuální vícekanálové pipety jsou pipety s přímým posunutím, které fungují obdobně jako jednokanálové pipety. Vícekanálové pipety jsou však vybaveny několika tryskami (zpravidla 8 nebo 12), které jsou uspořádané ve vodorovné řadě a na které se uchycují pipetovací špičky. Vzdálenost mezi jednotlivými kanály činí 9 mm, takže pipetu lze používat k práci s 96jamkovými destičkami, které představují nejčastější formát v biologických aplikacích.