Una reazione di alogenazione si verifica quando uno o più atomi di fluoro, cloro, bromo o iodio sostituiscono gli atomi di idrogeno nel composto organico. L'ordine di reattività è fluoro > cloro > bromo > iodio. Il fluoro è particolarmente aggressivo e può reagire violentemente con i materiali organici. Tende anche a rendere il più stabile degli organoalogenati ed è difficile rimuovere un atomo di fluoro una volta aggiunto. Al contrario, lo iodio è più difficile da aggiungere a una molecola organica, ma una volta che si forma uno iodoorganico, l'atomo di iodio viene facilmente rimosso. Quindi l'elettronegatività dell'atomo di alogeno è una forza trainante per le reazioni di alogenazione. Le reazioni dipendono anche dalla natura della molecola di substrato che viene alogenata.
Le alogenazioni avvengono attraverso diversi processi a seconda del substrato: idrocarburi saturi alogenati tramite un processo di radicali liberi; sostanze organiche insature alogenate tramite una reazione di addizione; alogenati aromatici tramite sostituzione elettrofila.
