En halogenerande reaktion inträffar när en eller flera fluor-, klor-, bromatom- eller jodatomer ersätter väteatomer i en organisk förening. Reaktivitetsordningen är fluor > klor > brom > jod. Fluor är särskilt aggressivt och kan reagera våldsamt med organiska material. Det tenderar också att göra de mest stabila av de organiska halogenerna och det är svårt att avlägsna en fluoratom när den väl har tillsatts. Omvänt är jod svårare att tillsätta till en organisk molekyl, men när en jodorganisk bildas avlägsnas jodatomen lätt. Således är halogenatomens elektronegativitet en drivkraft för halogeneringsreaktioner. Reaktionerna beror också på vilken typ av substratmolekyl som halogeneras.
Halogeneringar sker genom flera olika processer beroende på substratet: mättade kolväten halogenerar via en process med fria radikaler; omättade organiska ämnen halogenat via en additionsreaktion; Aromatiska halogenerat via elektrofil substitution.
