Галогенации являются исключительно полезными реакциями и охватывают широкую сферу применения в синтетической химии. Несколько примеров: хлорирование, бромирование и йодирование альдегидов и кетонов в α-положении являются прямыми, хотя такая реакция с фтором невозможна. Галогенирование α-водорода в карбоновых кислотах с бромом или хлором может происходить в результате реакции Целля-Фольхарда-Зелинского, однако необходим катализатор, такой как P или PBr3. Чем проще энолизировать подложку, тем легче ее галогенировать. По этой причине ацилгалогениды, ангидриды, малоновые эфиры подвергаются α-галогенированию без необходимости использования катализатора. В реакции перегруппировки Хоффмана используется бром для превращения амидов в амины. Ароматические кольца могут быть бромированными или хлорированными, но для них требуется катализатор, такой как Fe (на самом деле FeCl3) или AlCl3 или AlBr3. Фтор сам по себе слишком агрессивен для фторирования ароматических углеводородов, но существуют реагенты, такие как ClO3F, которые можно использовать для фторирования определенных субстратов, таких как фенолы. Как правило, бром и хлор легко галогенируют соединения с двойными и тройными связями.
Хотя используется галогенирование с X2 или HX, эти молекулы часто токсичны, коррозионны и трудно поддаются лечению. Например, фтор и HF невероятно коррозионны, реакционноспособны, вызывают нежелательные побочные продукты и в целом с ними трудно работать и контролировать экзотермию реакции. По этой причине были разработаны соединения, которые могут содержать атом фтора, но при этом являются более стабильными и контролируемыми. Например, трифторид диэтиламиносеры (DAST) представляет собой стабильное твердое вещество, которое преобразует спирты, альдегиды и кетоны в соответствующие фторидорганические соединения и гораздо безопаснее и удобнее в использовании, чем газообразные фтор или тетрафторид серы. Такие реагенты, как SOCl2 и PCl5, используются для получения хлорорганических соединений из соответствующих спиртов и, как и в случае с фтором, проще в использовании и управлении реакциями, чем с элементарным хлором. В качестве альтернативы брому N-бромсукцинимид (NBS) широко используется для бромирования алкена.